Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm1123Q1RME4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm1123Q1RME4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms