Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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