Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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