Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo3bQ1EG27 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms