Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CLPPQ16740 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CLPPQ16740 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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