Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3ip1Q149C2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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