Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VgfQ0VGU4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms