Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ttc39dQ0VF76 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ttc39dQ0VF76 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc39dQ0VF76 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ttc39dQ0VF76 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc39dQ0VF76 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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