Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.6 ms