Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms