Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Vps8Q0P5W1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms