Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrioQ0KL02 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms