Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf541Q0GGX2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf541Q0GGX2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms