Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd8Q09XV5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd8Q09XV5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms