Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700061G19RikQ08EE8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms