Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SctQ08535 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SctQ08535 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SctQ08535 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SctQ08535 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SctQ08535 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SctQ08535 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SctQ08535 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SctQ08535 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SctQ08535 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms