Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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