Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm3Q08189 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms