Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms