Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou6f1Q07916 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms