Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MestQ07646 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MestQ07646 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MestQ07646 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MestQ07646 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MestQ07646 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms