Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms