Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fmn1Q05860 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fmn1Q05860 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fmn1Q05860 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms