Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms