Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox12Q04890 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox12Q04890 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms