Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms