Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top1Q04750 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms