Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms