Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkczQ02956 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkczQ02956 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms