Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnb1Q02248 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms