Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdcd1Q02242 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms