Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcqQ02111 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms