Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms