Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ascl1Q02067 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms