Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col1a2Q01149 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms