Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga4Q00651 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms