Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabpaQ00422 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms