Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcf7Q00417 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcf7Q00417 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms