Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PgrQ00175 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PgrQ00175 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PgrQ00175 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms