Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bmp1P98063 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp1P98063 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms