Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Meis3P97368 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Meis3P97368 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Meis3P97368 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms