Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp1P97350 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms