Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RptnP97347 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RptnP97347 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RptnP97347 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RptnP97347 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RptnP97347 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RptnP97347 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RptnP97347 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RptnP97347 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms