Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubg1P83887 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms