Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx1P81068 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms