Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms