Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms