Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp9xP70398 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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