Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms