Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gfi1P70338 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms